Na ziemiach Beskidu Niskiego walczyli konfederaci barscy, którzy, m.in. pod wodzą Kazimierza Pułaskiego, zmagali się z wojskami carycy Katarzyny II. Wg niektórych historyków ruch ten był pierwszym polskim powstaniem. Ślady tych wydarzeń można odnaleźć w postaci okopów oraz mogił.
Kolejne wojny nie ominęły beskidzkiej krainy. Rozegrała się tu największa i najważniejsza bitwa na froncie wschodnim I wojny światowej – Bitwa Gorlicka. Dziś świadczą o niej cmentarze, licznie rozsiane po okolicznych miejscowościach. Od 2010 r., corocznie – pod koniec kwietnia, w Sękowej odbywa się rekonstrukcja bitwy pod Gorlicami. W inscenizacji uczestniczą grupy rekonstrukcyjne z kraju i zagranicy.
W paśmie Dukla-Przełęcz Dukielska miała miejsce z kolei jedna z najkrwawszych bitew II wojny światowej, w której zginęło blisko 200 000 ludzi. Nieopodal wsi Chyrowa znajduje się miejsce, które okoliczna ludność nazwała Doliną Śmierci.